雑多

内部のFFTWのビルドでは、バージョン3.3.10が使用されています。

-DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON オプションを有効にした場合、FFTW 3.3.10 をコンパイルします（以前の 3.3.8 版ではなく）。詳細については、FFTW のリリースノート を参照してください。

AWHパラメータ 'awh-nsamples-update' のデフォルト値を10から100に増加

これは、特に複数のウォーカーを使用する場合、バイアスの更新に伴うオーバーヘッドを削減することを目的としています。

シミュレーション部分間で拡張されたアンサンブルの平衡状態を継続するためのサポート

init-lambda-counts および init-wl-histogram-counts の mdp オプションを使用すると、サンプリングされたラムダ状態ごとのカウント数と、シミュレーションの平衡を決定するために使用されるワン・ランダウヒストグラムの数を初期化できます。 これらは、特に短いシミュレーション部分を実行する場合に役立ち、シミュレーション間でシステムの平衡に関する情報が伝達されるようになります。 そうでない場合、拡張エンsemble法を使用した場合、短いシミュレーション部分の連鎖は収束しません。 この情報は、チェックポイントファイルを通じて伝達されるようになります。

CTestは、テストを並行して実行できるようになりました。

テストバイナリとその依存関係のリソース要件を適切に表現することで、「ctest --parallel」を安全に使用できるようにする。