削除された mdrun の機能¶
SD2統合機能の削除¶
この統合モジュールには既知の問題があり、すべての点で sd よりも劣ります。テストは含まれておらず、GROMACS 5.0 で非推奨となりました。置き換えの計画はありません。
ツイン・レンジの仕組みを削除¶
この機能は、(非推奨)のグループスキームのみでサポートされており、Verletスキームでは、近い将来、サポートされません。 現在、rlist >= max(rcoulomb,rvdw)という明示的な要件があります。
VV統合器を使用したツインレンジのサポートを削除¶
グループスキームにおける、非結合的な双方向相互作用は、速度-ヴェルテ integratorsと制約を使用する場合に動作しません。 この組み合わせを動作するようにする計画はありません。
削除された機能: Reaction-Field-nec¶
「反応場における除外修正オプション」は、主に互換性の維持と、剛性分子のみ（例：水）を持つシステムでのパフォーマンス向上のために導入されました。他のすべてのシステムでは、力が正しくなくなります。Verletスキームは、このオプションをサポートしていません。また、サポートした場合でも、パフォーマンスは向上しません。
AdResS モジュールが削除されました¶
この機能は、（廃止された）グループスキームを必要とし、Verletスキームへの移行の計画はありません。
削除された mdrun -compact¶
ステップごとのデータを分析する方法を複数サポートするのは、複雑すぎる。
`mdrun`ログファイルからのラムダ関数の出力削除¶
GMX_NOCHARGEGROUPSの削除¶
このドキュメントに記載されていない機能は、(廃止された) グループスキームを使用した場合にのみ役立ちました。