修正されたバグ¶
gmx mdrun -append は、チェックポイントが存在することを確認するようになりました。¶
以前、gmx mdrun -append は、チェックポイントファイルが存在しない場合に、.tpr 設定から開始される（つまり、追加処理は行われない）ようになっていました。
Verlet バッファは、現在も正しく歪み条件を処理します。¶
自由エネルギー計算において、制約が変更された場合に、Verletバッファの値を過小評価することがありました。通常、非常にわずかしか制約が変更されるため、その影響は非常に小さく、近似によるバッファの過大評価よりもはるかに小さいため、ほとんどの制約が変更された実行結果は影響を受けていません。