gmxapi Python モジュールに関するリファレンス

GROMACS Python パッケージには、純粋な Python で実装された高レベルのスクリプトインターフェースと、C++ 拡張モジュールとして実装された低レベルの API が含まれています。 純粋な Python 実装では、非常に安定した構文を備えた基本的な gmxapi モジュールとクラスを提供し、低レベルのインターフェースとの互換性を維持しながら、複雑さを軽減できます。 この分離は、異なる実行コンテキストがかなり異なる方法で実装されていることを思い出させるものでもありますが、高レベルのインターフェースのみを使用する Python スクリプトは、すべてで実行されます。

パッケージのドキュメントは、gmxapi Python モジュールから抽出され、コマンドラインの pydoc または Python 内（インタラクティブなセッション中など）の help() を使用して直接アクセスすることも可能です。

詳細については、Python のソースコードを参照してください。

参考

このドキュメントは、gmxapi パッケージをインストールせずに作成されました, そのため、完全なモジュール参照は含まれていません。完全なドキュメントの作成方法については、gmxapiドキュメントへのアクセス を参照するか、オンライン版 <http://manual.gromacs.org/current/gmxapi/> をご覧ください。