GROMACS ツールへの改善

gmx do_dssp が DSSP アルゴリズムのネイティブ実装に置き換えられました。

gmx do_dssp は、DSSP アルゴリズムのネイティブ実装（バージョン 4）に置き換えられました。バージョン 4 の結果は、以前は gmx do_dssp -ver 4 を使用して取得できました。新しいツールは gmx dssp となっています。