削除された機能

NVIDIA GPUでのNVMLサポートが削除されました。

NVML のサポート（GPU アプリケーションのクロックを報告したり、より高いスループットのために変更したりする機能）は、現在は利用できません。この機能は、主にハイエンドハードウェアでのみサポートされており、クロックの変更は、ユーザーが root 権限を持っている場合にのみ、最近のハードウェア世代で有効です。GROMACS が進化し、GROMACS のコードを複雑にするだけでなく、定期的なテストやメンテナンスが行われていないため、この機能は徐々に役に立たなくなる可能性があります。これらの条件が変化した場合、この機能が再び利用可能になる可能性があります。

CUDA Compute Capability 2.x のサポートを削除

2010年代初頭のフェルミ世代のGPUは、現在では広く使用されておらず、Jenkinsでのテストも行われていないため、コードが複雑になり、サポートも終了しています。

コンリブディレクトリが削除されました

このコードは長年にわたってメンテナンスされていなかったため、おそらく機能しなくなっており、削除されました。もし誰かが必要とする場合は、gitの履歴に記録が残っています。

BlueGene のサポートが削除されました

これらのマシンはほとんどが退役しており、GROMACS 5.1以降、ポートの積極的なメンテナンスが行われていないため、BlueGeneおよびQPX SIMDに対するサポートは削除されました。

暗黙の溶媒サポートが削除されました

Gromacs -4.6以降、SIMDおよびマルチスレッディングのサポートはほとんど機能しなくなりました。誰も修正する意思がないため、この機能は削除されました。このようなシミュレーション用のパラメータを含む古いフォースフィールドファイルは読み込むことができますが、その値は無視されます。

削除された gmx mdrun -multi

「gmx mdrun -multidir」の機能の実装は、より信頼性が高く、より多くの機能に対応しています。重複した機能の維持は誰にもできませんでした。