主なポイン

GROMACS 2021年1月28日にリリースされました。それ以降にパッチリリースが行われている可能性がありますので、最新版をご利用ください。以下に、期待できる主な機能と、詳細については以下のリンクをご参照ください!

もちろん、今回も、GPUを使用する場合としない場合の両方で、複数の便利なパフォーマンス改善機能が、デフォルトで有効化され、自動化されています。さらに、シミュレーションを実行するための新しい機能がいくつか追加されました。新しいバージョンが、お客様のシミュレーションとハードウェアでどのように動作するかについて、ぜひフィードバックをお寄せください。追加された機能は以下の通りです。

  • 複数の時間ステップのサポートにより、シミュレーション速度を単純に2倍に向上させることが可能となり、仮想サイトの処理を置き換えることを目的としています。

  • 確率的なセル再スケーリングバロスタットを使用して、平衡と生産シミュレーションを実行できる機能

  • SYCL をアクセラレータフレームワークとして使用するための初期的なサポート

  • AWH を使用した自由エネルギー摂動の実行をサポート

  • PME(局所密度近似)の計算をGPUにオフロードし、自由エネルギーシミュレーションを高速化する

  • ARM SVEおよび富士通A64FX(情報科学技術研究所(RIST)による貢献)のサポート

  • 新しい非相互作用API(NB-LIBとの連携、PRACEとの共同開発)

  • 新しい|Gromacs|ロゴ!