主なポイン

GROMACS 2019は2018年12月31日にリリースされました。それ以降にパッチリリースが行われている可能性があります。最新バージョンをご利用ください。以下に、期待できる主な機能と、詳細については以下のリンクをご参照ください！

もちろん、今回も、GPUを使用する場合としない場合の両方で、いくつかの役立つパフォーマンス改善を導入しました。これらの改善は、デフォルトで有効化され、自動的に適用されます。シミュレーションとハードウェアでの動作について、皆様からのフィードバックをぜひお聞かせください。具体的には、以下の点についてご意見をお聞かせください。

• シミュレーションは、座標更新のみがグループ内の依存関係を持つ原子グループの更新グループを使用して自動的に実行されます。これには、制約と仮想サイトの両方が含まれます。これにより、更新時のオーバーヘッドが排除され、パフォーマンスが向上します。

• Intel製の統合GPUは、非結合相互作用のオフロードにOpenCLを使用できるようになりました。

• PMEの長距離相互作用は、OpenCLを使用して単一のAMD GPUでも実行できるようになり、これにより、そのようなハードウェアで優れたパフォーマンスを得るために、必要なCPUコアの数が大幅に削減されます。