GROMACS 2021.7 リリースノート¶
このバージョンは2023年1月31日にリリースされました。これらのリリースノートは、|Gromacs|の2021.6バージョンからの変更を記録し、既知の問題を修正することを目的としています。また、2020.7およびそれ以前のすべての修正も含まれており、詳細は:ref:`release-notes`で確認できます。
mdrunが誤った動作をする問題を修正¶
GPUでPMEを実行する際に、欠落していたネット電荷の項を追加する¶
PMEがGPU上で実行されている場合、システム全体の電荷の変化が考慮されていませんでした。通常の実行では、これは通常、ポテンシャルエネルギーを一定の値でしか変化させません。ただし、フリーエネルギー計算において、システム全体の電荷が変化する場合、これは不正確な dV/dlambda と Delta lambda の値につながります(ただし、フリーエネルギー計算でシステム全体の電荷を変化させることは避けるべきです)。