削除された機能¶

グループ分割スキーム¶

グループカットオフの仕組みが削除されました。これにより、それらに依存していたいくつかのシミュレーションは動作しなくなりました。

真空条件下でのシミュレーションはサポートされていません。

ユーザーが提供したテーブルによる、近距離の非相互作用の計算はサポートされていません。

PMEを使用した近距離非相互作用はサポートされなくなりました。

膜埋め込み機能が無効化されました。

QMMMはサポートされていません。

これは、グループ化された設定でのみ正しく機能します。標準の反応場と計算を使用して、一般化された反応場シミュレーションを実行し、誘電定数を手動で計算することも可能です。

`gmx anadock`ツールは削除されました。これは、AutoDockの出力（分析）を行うものであり、|Gromacs|には含まれていません。

`gmx dyndom`ツールは、|Gromacs|に属さないため削除されました（DynDomの出力を分析します）。

gmx morphツールは、スクリプトで簡単に実現できる非物理的な構造を生成するため、削除されました。

この機能は、さまざまな .mdp 設定の効果を、理解しにくく、報告することが困難な方法で上書きすることがありました。PP ランク間の通信を行うユーザーは、必要に応じて nst* の mdp オプションを適切に選択する必要があります。