GROMACS 2018.6 リリースノート¶
このバージョンは2019年2月22日にリリースされました。これらのリリースノートは、|Gromacs|のバージョン2018.5以降に変更された内容を記録し、既知の問題を修正することを目的としています。また、これまでのバージョンで実施されたすべての修正も含まれており、詳細は：ref:`release-notes`で確認できます。
mdrunが誤った動作をする問題を修正¶
自由エネルギーΔHの出力値を質量λで正しく修正する¶
別々のラムダパラメータが歪んだ質量フリーエネルギーへの寄与に使用された場合、これらの寄与は、BAR計算に使用されるΔH出力で二重にカウントされていました。ただし、d(ΔH)/d(lambda)は常に正しい値でした。
GPUでの不適切なLJ反発力の切り替えを修正¶
CUDAまたはOpenCL GPUを使用する場合、「A」と記載されているLJ反発力の2次項の係数が誤っていました。これにより、力の計算と圧力計算に非常に小さな誤差が生じました。ただし、分散力の切り替えは正しく機能していました。このバグが物理的な結果に与える影響はほとんどないと考えられます。ただし、力の切り替えは通常、CHARMM力場と組み合わせて使用されます。
gmx ツールに関する修正¶
移植性を向上させるための修正¶
Power8 用のコンパイラフラグを修正¶
Power8プロセッサ向けのコンパイラオプションが原因でコードにエラーが発生するため、このオプションは削除されました。