GROMACS 2024.5 リリースノート¶
このバージョンは2025年1月24日にリリースされました。これらのリリースノートは、|Gromacs|の2024.4バージョン以降に変更された内容を記録し、既知の問題を修正することを目的としています。また、2023.5およびそれ以前のすべての修正も含まれており、詳細は：ref:`release-notes`で確認できます。
mdrunが誤った動作をする問題を修正¶
AWHおよびマルチ・シン・バイアス共有に関するクラッシュを修正¶
gmx mdrun で AWH を使用し、バイアス共有を行う場合、1 つの PP ランクと 1 つの PME ランク、または複数の PP ランクでクラッシュする可能性があります。
完全凍結された原子を含むT-結合グループにおける問題を修正¶
gmx grompp は、完全に凍結された原子が、温度結合グループの一部であり、同時に非凍結の原子も含まれている場合に、誤って3つの自由度を減算していました。これにより、温度結合を使用した場合に、不適切な高温と低い実際の温度が報告されるようになりました。ただし、出力の温度を見るだけでは、この問題は検出できません。なぜなら、これはバスの温度と一致するからです。
モジュール式シミュレーター、MD積分、DDと制約に関するクラッシュを修正¶
モジュール式シミュレータ、md積分、ドメイン分割、および制約の組み合わせにより、不正なメモリアクセスが発生し、ステップ0より前にクラッシュすることがありました。
gmx ツールに関する修正¶
gmx tcaf での軌道読み込みエラーの処理¶
gmx tcaf は、軌跡の読み込みに失敗した場合に、詳細なエラーメッセージを表示して停止します。
移植性に影響を与える修正¶
WindowsでIntel oneAPIを使用する場合のリンクエラーを修正¶
LINK : fatal error LNK1181: cannot open input file ‘m.lib’ エラーが発生した場合、Windows で icx コンパイラを使用する際に、動的に検出された m ライブラリの名前を使用することで修正します。
Visual Studio 2022 で内部コンパイラエラーを回避する方法¶
Visual Studio 2022 では、「calc_verletbuf.cpp」のコンパイル時にエラーが発生します。これはコンパイラ内のバグですが、この問題を修正するための回避策を導入しています。