gmx mk_angndx

概要

gmx mk_angndx [-s [<.tpr>]] [-n [<.ndx>]] [-type <enum>] [-[no]hyd]
             [-hq <real>]

説明

gmx mk_angndx は、角度分布などの計算のためのインデックスファイルを作成します。 角度、ジヘドラなどの定義は、入力ファイル（.tpx）から読み取ります。

オプション

入力ファイルの指定オプション:

-s [<.tpr>] (topol.tpr)

ポータブル XDR 実行入力ファイル

出力ファイルの指定オプション:

-n [<.ndx>] (angle.ndx)

インデックスファイル

Other options:

-type <enum> (angle)

角度の種類: 角度、二面角、不適切な角度、ryckaert-bellemans

-[no]hyd (はい)

質量が1.5未満の原子を含む角度を含める

-hq <実数値> (-1)

質量が1.5未満で、その電荷の大きさがこの値以下の原子を含む角度は無視する