GROMACS 2020.3 リリースノート¶
このバージョンは2020年7月9日にリリースされました。これらのリリースノートは、|Gromacs|の2020.2バージョン以降に変更された内容を記録し、既知の問題を修正することを目的としています。また、2019.6バージョン以前に実施されたすべての修正も含まれており、詳細は：ref:`release-notes`で確認できます。
mdrun が誤った動作をする問題を修正¶
gmx ツールに関する修正¶
古い tpr ファイルの特定を正しく読み取る問題を修正¶
特定の古い tpr ファイルは、通常、メモリ割り当てエラーで終了する、誤って読み込まれる可能性があります。
修正: gmx lie でのセグメンテーション違反¶
このツールは、ファイルとF_NRE内のエネルギー項のサイズが一致しない場合にクラッシュする。
修正：gmx xpm2ps でのマトリックス読み込み¶
このツールは、2番目の行列が提供されていない場合、行列を読み取ることができません。
gmx hbond で初期化されていない変数の警告を修正¶
ツールは、初期化されていないメモリを使用するため、無効なデータを出力していました。
実際に gmx do_dssp を修正¶
このツールは、前の修正後も依然として機能不良で、誤った結果を出力していました。
dssp のデフォルトパスの設定を可能にする¶
ユーザーは、GMX_DSSP_PROGRAM_PATHを使用して、dsspのデフォルトパスを設定できます。
gmx genrestr でセグメンテーション違反を回避する¶
このツールは、解放されたメモリへのアクセスによって発生するメモリアクセスエラーにより、単純な入力の実行時に失敗する可能性があります。
移植性に影響を与える修正¶
MSVC SIMD フラグの更新¶
新しいSIMDフラグのサポートにより、最新のx86プロセッサでWindowsを実行している場合にパフォーマンスが向上する可能性があります。
修正：tinyxml2とのリンクに関するエラー¶
外部ライブラリへのリンク設定の署名が正しくありませんでした。
その他の機能¶
GPUを使用した非動的インテグラターの使用に関するメッセージが更新されました¶
PME（ポテンシャルエネルギー計算）および結合力の実装におけるGPUの使用には、動的積分が必要です。GPUを使用したPMEまたは結合力の使用が、非動的積分を使用する場合にサポートされていないというメッセージが、より明確になりました。