主なポイン

GROMACS 2022年2月22日にリリースされました。それ以降にパッチリリースが行われている可能性がありますので、最新版をご利用ください。以下に、期待できる主な機能と、詳細については以下のリンクをご参照ください！

もちろん、今回も、GPUを使用する場合としない場合の両方で、いくつかの便利なパフォーマンス改善が、デフォルトで有効化され、自動化されています。さらに、シミュレーションの実行に役立ついくつかの新機能が利用可能です。新機能が、お客様のシミュレーションとハードウェアでどのように動作するかについて、フィードバックをお待ちしております。新機能は以下のとおりです。

  • フリーエネルギー計算をGPUを使用する場合、SIMDを使用して高速化することで、計算速度が最大3倍に向上します。

  • 新しいソフトコアの非相互作用の形式により、自由エネルギー計算において、アルケマイカル変換経路をより細かく制御することが可能になります。

  • 新しい変換による座標の指定により、他の複数の座標に対して任意の数学的な変換を実行できます。

  • CP2K 量子化学パッケージを使用した、多スケール 量子力学 / 分子力学 (QM/MM) シミュレーションのための新しいインターフェース。周期境界条件をサポート。

  • grompp のパフォーマンス改善

  • クールな引用と音楽のプレイリスト

  • モジュール式シミュレータに、追加機能が移植されました。

  • AdaptiveCpp (hipSYCL) を使用して、AMD GPU のサポートを追加

  • SYCL (PME、GPUアップデート) を使用することで、さらに多くの GPU オフロード機能がサポートされます。

  • GPUアクセラレーションを使用した並列処理の改善、CUDAと拡張されたGPU間直接通信により、CUDAに最適化されたMPIを使用したマルチノードシミュレーションをサポート。