修正されたバグ¶
修正:テスト粒子の挿入時に、分散補正の重複計算を修正¶
テスト粒子のシステムとの分散補正が二重にカウントされていました。
gmx grompp は、同一の分子のテスト粒子挿入を許可します。¶
gmx grompp は、同じ分子タイプを持つトポロジー内の分子ブロックをマージします。TPI を使用すると、同じ分子の液体に分子を挿入することが防止されました。
まれに発生する、歪み排除に関するエラーが修正されました¶
まれに、ペアの相互作用がゼロになっているシステム(例えば、一部の水素原子が相互作用しない状態など)の場合、gmx mdrun が、排除された相互作用がカットオフを超えているというエラーメッセージで終了することがあります。しかし、実際にはそうではありません。